REAL TIME PCR TRONG NGHIÊN CỨU GEN NGƯỜI - HUMAN GENETICS
CHEK2 SNP genotyping Kit B1
NGHIÊN CỨU GEN NGƯỜI - HUMAN GENETICS
|
STT
|
Tên bộ kits
|
Mô tả tổng quát
|
Chứng chỉ
|
1
|
CHEK2 SNP genotyping Kit B1
(phát hiện đột biến gen CHEK2 gây ung thư vú)
|
Phương pháp phát hiện: Rt
Mẫu xét nghiệm: máu ngoại vi toàn phần
Phương pháp tách chiết DNA: PREP-NA-GENETICS, PREP-MP-GENETICS or PREP-RAPID-GENETICS
Định dạng bộ kit: non-pipetted (tube nên được mua thêm)
Nhiệt độ bảo quản: +2 .. + 8 ºС; Taq-polymerase: - 20 ºС
Thời hạn sử dụng: 6 tháng
|
RUO
|
Đột biến gen CHEK2 thuộc về đột biến cấp II trong các gen liên quan đến các quá trình sao chép DNA, sao chép, tái tổ hợp và sửa chữa. Các gen mã hóa các enzyme khác nhau (ví dụ như polymerase, helicase, topoi- somerase, vv) và chu trình tế bào điều chỉnh protein. Khuyết tật trong các gen này là kết quả của sự bất ổn định nhiễm sắc thể và do đó có thể dẫn đến các bệnh ung thư khác nhau [53].
Ý nghĩa lâm sàng của việc phát hiện đột biến gen CHEK2 không thấp hơn so với gen BRCA1 và BRCA2, đặc biệt là trong trường hợp ung thư gia đình. Chúng tôi đề nghị thực hiện thử nghiệm dòng thứ hai cho một số đột biến trong các gen này nếu thu được kết quả âm tính đối với việc vận chuyển đột biến BRCA1 và BRCA2. Hơn nữa, một số hội chứng di truyền, có đặc điểm chính là một khuynh hướng bất ổn định nhiễm sắc thể, được mô tả. Đối với một số hội chứng như vậy, kết hợp với vận chuyển dị hợp tử của đột biến gen CHEK2 đã được chứng minh [30,104,123].
CHEK2 mutations (đột biến CHEK2)
The CHEK2 gene (cell-cycle checkpoint kinases 2) mã hóa một protein được gọi là điều chỉnh điểm kiểm tra chu kỳ tế bào, có liên quan đến quá trình sửa chữa DNA và trong quá trình điều chỉnh phân chia tế bào. Sản phẩm của gen này là một loại enzyme gọi là enzyme protein kinase và được tổng hợp để phản ứng lại với các phân tử DNA. Cơ chế hoạt động là chặn chu kỳ tế bào trong pha G1 hoặc khởi động quá trình apoptosis, đồng thời ngăn chặn sự chuyển đổi ác tính của các tế bào. Các đột biến gen CHEK2 dẫn đến sự biểu hiện của protein bị cắt ngắn bị lỗi và chúng có liên quan đến sự xuất hiện của các loại u ác tính di truyền khác nhau. Ba đột biến là quan trọng nhất: In the CHEK2 gene 1100delC, IVS2 + 1G> A and 470T> C Ile157Thr.
Đột biến 1100delC trong gen CHEK2 là phổ biến ở nhiều quốc gia. Tần số alen đột biến là 1,1-1,4% trong cộng đồng châu âu. Nó đã được chỉ ra rằng đột biến 1100delC có liên quan đến ung thư vú. Một nghiên cứu ở quy mô lớn của Hiệp hội Kiểm soát Ung thư Vú Quốc tế Breast Cancer Case-Control Consortium, bao gồm hơn 10.000 bệnh nhân ung thư vú và 9.000 phụ nữ khỏe mạnh từ năm quốc gia, phát hiện rằng tỷ lệ nguy cơ đối với các đột biến 1100delC trong gen CHEK2 là 2,34 [32, 41].
IVS2 + 1G>A Một đột biến ở gen CHEK2 hiếm hơn 1100delC và dẫn đến sự hình thành protein không có chức năng. Đột biến có liên quan đến sự xuất hiện của các bệnh ung thư về nội địa hóa khác nhau, đầu tiên và trước hết là ung thư vú. Nó phổ biến hơn ở các cư dân Đông Âu và Bắc Mỹ. Trong một mẫu lớn dân số Đông Âu (khoảng 2000 bệnh nhân), nó được thiết lập rằng IVS2 + 1G> Một alen có liên quan rõ ràng với ung thư tiến triển (OR = 2.0) [37].
Đột biến đột biến 470T> C (Ile157Thr) trong gen CHEK2 có liên quan đến hội chứng Li-Fraumeni, ung thu vú và ung thư tuyến tiền liệt, ung thư đại tràng và trực tràng. Đột biến này thường xuyên hơn 1100delC và IVS2 + 1G> A, và nó được tìm thấy trong dân số (với tần số 4-5%). Sự thay thế axit amin của iso- leucine với threonine làm giảm hoạt động chức năng của protein. Bên cạnh đó, các protein đột biến tạo thành dimers với protein loại hoang dã, do đó làm giảm hoạt động của nó. Trung bình, sự hiện diện của đột biến Ile157Thr của gen CHEK2 làm tăng nguy cơ ung thư vú ở mức độ thấp hơn so với việc vận chuyển các đột biến CHEK2 khác [26, 68, 92].
Chỉ định xét nghiệm di truyền:
-
Tiền sử gia đình (ung thư vú, ung thư tuyến tiền liệt, hoặc ung thư đại trực tràng ở người thân mức độ đầu tiên);
-
Một hoặc nhiều họ hàng có cùng loại khối u;
-
Các bệnh vú tăng sinh không điển hình;
-
Nhiều khối u chính trong cùng một cơ quan;
-
Nhiều khối u chính trong các cơ quan khác nhau;
-
Nhiều khối u chính trong các cơ quan ghép nối;
-
Đa nguyên trong một cơ quan;
-
Biểu hiện khối u ở độ tuổi sớm;
-
Hai hoặc nhiều người thân bị các dạng ung thư hiếm gặp;
-
Hai hoặc nhiều người thân có khối u liên quan đến ung thư gia đình;
-
Ba hoặc nhiều người thân trong hai thế hệ với các khối u của một địa phương hóa;
-
Kết quả xét nghiệm âm tính đối với đột biến gen BRCA1 và BRCA2
Nếu các đột biến được phát hiện tại phòng thí nghiệm, nó là cần thiết để xem một bác sĩ chuyên khoa ung thư hoặc ghé thăm các trung tâm chuyên khoa ung thư. Ở đó, họ sẽ xác định các chiến thuật để kiểm tra thêm và, nếu cần thiết, chỉ định điều trị dự phòng tùy thuộc vào độ tuổi của bệnh nhân, tiền sử gia đình và tình trạng lâm sàng cụ thể.
DNA-Technology đã phát triển một bộ kits (xem Bảng 45) để phát hiện các đa hình CHEK2 liên quan đến bệnh lý ung thư bằng kỹ thuật real time PCR.
Bảng 45. Thông số kỹ thuật và cung cấp hoàn chỉnh bộ thuốc thử
Số test
|
48 tests
|
Định dạng bộ kits
|
Not pre-aliquoted
|
Taq-AT polymerase
|
1 tube (48 mcl)
|
Mineral oil
|
2 tubes (960 mcl)
|
PCR buffer
|
2 tubes (480 mcl)
|
Đa hình được xác định
|
CHEK2: 1100delC/IVS2+1G>A– 960 mcl CHEK2: 470 T>C (Ile157Thr) – 960 mcl
|
Kiểm soát mẫu dương (C +) [đồng hợp tử cho alen bình thường đối với tất cả các đa hình]
|
1 tube (100 mcl)
|
Mẫu cho phân tích
|
Máu toàn phần
|
Công nghệ:
-
Chỉ sử dụng công nghệ PCR melting;
-
Không được phép sử dụng các công nghệ khác.
Nhiệt độ lưu trữ: +2 đến +8 ° C (-20 ° C đối với Taq-AT-polymerase).
Thiết bị cần thiết để phân tích:
Các thiết bị DT được sản xuất bởi DNA-Technology: DTlite, DT- prime.
Máy real time PCR “DTprime” và “Dtlite” – HSX: DNA – Technology
Nhà phân phối độc quyền tại Việt Nam: Công ty TNHH Thiết Bị BDE
Thuốc thử bổ sung:
Mẫu thử dương tính * (xem Bảng 47). Bộ này bao gồm bốn ống có nắp vặn:
-
Mẫu thử № 1 [dị hợp tử cho CHEK2: 1100delC] - 1 ống (50 mcl);
-
Mẫu thử № 2 [dị hợp tử cho CHEK2: IVS2 + 1G> A] - 1 ống (50 mcl);
-
Mẫu thử № 3 [dị hợp tử cho CHEK2: 470T> C (Ile157Thr)] - 1 ống (50 mcl);
-
Mẫu thử № 4 [đồng hợp tử cho alen đột biến CHEK2: 470T> C (Ile157Thr)] - 1 ống (50 mcl).
Sử dụng cùng với các thuốc thử CHEKS2 mutations - CHEKS2 đột biến
Bảng 46. Các kiểu gen, được xác định trong các mẫu đối chứng dương tính
PCR-mix
|
Đa hình (đột biến)
|
Kiểu gen
|
C+
|
Positive control
|
№ 1
|
№ 2
|
№ 3
|
№ 4
|
CHEK2:1100delC/IVS2+1G>A
|
CHEK2:1100delC
|
Ins/Ins
|
Ins/Del
|
Ins/Ins
|
–
|
–
|
CHEK2:IVS2+1G>A
|
G/G
|
G/G
|
G/A
|
–
|
–
|
CHEK2:47OT>C (Ile157Thr)
|
CHEK2:47OT>C (Ile157Thr)
|
Т/Т
|
–
|
–
|
Т/С
|
С/С
|
Tài liệu tham khảo: DNA-Technology
Quý khách hàng vui lòng liên hệ với BDE – đơn vị phân phối độc quyền tại Việt Nam để được tư vấn miễn phí:
Công ty TNHH Thiết Bị B.D.E
Số 44, TT 3 - Khu Đô Thị Văn Phú - Hà Đông - Hà Nội
Tel : 02466 807 528 Fax 0433 513 114
Hotline 097 664 11 99