REAL TIME PCR TRONG NGHIÊN CỨU GEN NGƯỜI - HUMAN GENETICS
HCV THERAPY SENSITIVITY SNP genotyping Kit (IL28B Detection) (2 SNPs)
NGHIÊN CỨU GEN NGƯỜI - HUMAN GENETICS
|
STT
|
Tên bộ kits
|
Mô tả tổng quát
|
Chứng chỉ
|
19
|
HCV THERAPY SENSITIVITY SNP genotyping Kit (IL28B Detection) (2 SNPs)
(chẩn đoán Độ nhạy trị liệu HCV bằng real time PCR)
|
Phương pháp phát hiện: Rt
Mẫu xét nghiệm: máu ngoại vi toàn phần
Phương pháp tách chiết DNA: PREP-GS-GENETICS, PREP-RAPID-GENETICS
Định dạng bộ kit: non-pipetted (tube nên được mua thêm)
Nhiệt độ bảo quản: +2 .. + 8 ºС;
polymerase TechnoTaq AT: -20 ºС
Thời hạn sử dụng: 6 tháng
|
CE/IVD
|
Hepatitis C virus - Vi-rút viêm gan C là một bệnh truyền nhiễm trên toàn thế giới lan rộng do vi-rút viêm gan C (HCV), đã lây nhiễm cho khoảng 170 triệu người [131].
Sau khi viêm gan C cấp tính, siêu vi khuẩn này vẫn tồn tại trong máu của 85-90% bệnh nhân, bất kể đường lây nhiễm. Trong 50-70% bệnh nhân, bệnh sau đó trở thành viêm gan mãn tính. Thông thường, viêm gan mãn tính tiến triển rất chậm và không có biểu hiện lâm sàng trong một thời gian dài. Tuy nhiên, ngay cả ở bệnh viêm gan C mãn tính nhẹ, gần 30% bệnh nhân bị xơ gan sau 30 năm, có thể gây ung thư tế bào gan [5, 42, 103].
Trong bệnh viêm gan C mãn tính, trước đây được coi là một căn bệnh nan y, liệu pháp kháng virus hiện đại cho phép loại bỏ vi-rút, ngăn ngừa các biến chứng nghiêm trọng của viêm gan siêu vi mãn tính (xơ gan, ung thư biểu mô tế bào gan) và duy trì khả năng làm việc ở 40-60% bệnh nhân [31] .
Trong những năm qua, liệu pháp đơn trị liệu interferon alpha là cơ sở để điều trị viêm gan C. Điều trị kháng virus hiện đại liên quan đến điều trị phối hợp pegylated interferon và ribavirin (PEG-IFN / RBV) theo khuyến cáo của Hiệp hội Nghiên cứu Bệnh gan Hoa Kỳ (AASLD) trong năm 2009 và Hiệp hội Nghiên cứu Gan Châu Âu (EASL) năm 2011 [35].
Mục tiêu của điều trị là đạt được đáp ứng virus kéo dài (SVR), tức là sự vắng mặt lâu dài (ít nhất 6 tháng) của virus được phát hiện trong máu sau khi ngừng điều trị kháng virus. SVR đi kèm với bình thường hóa các thông số sinh học, cải thiện mô học gan (giảm chỉ số hoạt động mô học và chỉ số xơ hóa) và cải thiện chất lượng cuộc sống của bệnh nhân [48, 52, 116].
Các phương pháp điều trị kháng virus cho bệnh viêm gan C mãn tính được xác định bằng tỷ lệ đáp ứng virus, cái gọi là liệu pháp điều trị bằng đáp ứng virus. Những năm gần đây đã chứng kiến sự xuất hiện của một phương pháp được sử dụng để dự đoán đáp ứng với liệu pháp dựa trên động học của virus trong giai đoạn đầu của điều trị. Thời gian điều trị cũng phụ thuộc vào đáp ứng virus học. Kiểm soát virus bằng PCR vào tuần điều trị thứ 4, 12 và 24 cho phép ước tính thời gian điều trị tối ưu [87, 139].
Sau đây là những biện pháp phản hồi :
-
Đáp ứng virus nhanh (RVR) (aviremia ở tuần điều trị thứ 4);
-
Đáp ứng virus sớm (EVR) (ước tính tuần thứ 12 của điều trị):
-
Hoàn thành đáp ứng virus sớm (cEVR) (aviremia);
-
Đáp ứng virus sớm một phần (pEVR) (giảm tải lượng virus hơn 2 log IU / ml);
-
Không đáp ứng virus (VNR) (aviremia ở tuần điều trị thứ 24);
-
Null response (NR) - giảm tải lượng virus ít nhất 2 log MЕ / ml sau 12 tuần điều trị..
Thời gian điều trị cần thiết để đạt được SVR được xác định bằng tỷ lệ giảm tải lượng virus và các đặc điểm cơ bản như giai đoạn xơ hóa, mức độ tải lượng virus HCV và kiểu gen HCV.
Đáp ứng virus bền vững (SVR) là một tiêu chí đáng tin cậy để loại bỏ vi-rút khỏi cơ thể, có thể được xem như một cách chữa trị. Xác suất SVR tỷ lệ thuận với thời gian biến mất RNA HCV trong khi điều trị.
Yếu tố dự báo chính của thành công điều trị là thành công RVR khi sử dụng phương pháp PCR định lượng với độ nhạy 50 IU / ml. Thành tựu của RVR là một yếu tố dự báo sự khởi đầu của SVR bất kể kiểu gen và chế độ điều trị được sử dụng [35].
Thật không may, dưới điều trị kháng virus kéo dài (48 hoặc 72 tuần ở kiểu gen HCV 1), chất lượng cuộc sống của bệnh nhân có thể xấu đi và tác dụng phụ của điều trị có thể xuất hiện: rối loạn thần kinh (khó chịu, mất ngủ, tâm trạng mệt mỏi, Mệt mỏi và khó chịu), sốt , giảm nồng độ hemoglobin, thay đổi chức năng tuyến giáp, rụng tóc và khô da. Đôi khi, các tác dụng phụ rõ rệt đến mức phải ngừng điều trị.
Rõ ràng, xác định các yếu tố quyết định đáp ứng điều trị, bao gồm các yếu tố quyết định di truyền, là rất quan trọng, vì các bác sĩ cần tiêu chí để dự đoán hiệu quả điều trị. Nói cách khác, trước khi bắt đầu điều trị chuẩn, bệnh nhân phải được thông báo về mối liên hệ giữa khả năng đạt được SVR và nguy cơ tác dụng phụ của thuốc kháng virus được sử dụng.
Hiện nay đã được xác định rõ rằng những thay đổi trong cụm gen cytokine (IL28A, IL28B và IL29), được định vị trên nhiễm sắc thể 19 (19q13) của một người, là yếu tố quyết định phòng thủ chống virus (Hình 39). Tính đa dạng trong khu vực tiếp giáp với interleukin 28B (IL28B) có tầm quan trọng lớn nhất. Cả hai dạng đa hình này đều ghi nhãn phần quan trọng để đáp ứng với điều trị kháng virus.
Hình. 39. Sự xác định vị trí gen IL28B và hai đa hình có ý nghĩa chức năng rs12979860 C> T và rs8099917 T> G
IL28B là interferon-λ-3, và là phối tử của thụ thể cytokine loại II. Các phối tử này kích hoạt đường truyền tín hiệu JAK / STAT bằng cách kích hoạt tổng hợp 2 ', 5'-oligoadenylate synthase, kích hoạt endonuclease. Endonuclease, đến lượt nó, tham gia vào sự kích thích protein kinase của enzyme, nó ngăn chặn sự tổng hợp protein của virus. Nó cho thấy rằng đa hình IL28B được định nghĩa là xác suất loại bỏ HCV tự phát, và đáp ứng với liệu pháp phối hợp interferon và ribavirin [62, 66].
Hai sự thay thế nucleotide đơn lẻ đóng vai trò quan trọng trong nhiễm virus viêm gan C::
-
Сytosine-to-thymine thay thế (C> T), được gắn nhãn là rs12979860 trong cơ sở dữ liệu dbSNP của Trung tâm quốc gia về thông tin công nghệ sinh học, NCBI;
-
Thay thế thymine-to-guanine (T> G), có nhãn là rs8099917.
Các chất mang kiểu gen rs12979860 CC có tăng gấp đôi khả năng đáp ứng tích cực với liệu pháp phối hợp interferon và ribavirin - cả ở những bệnh nhân thuộc tổ tiên châu Âu (p = 1.06 * 10 (-25)) và ở châu Phi (p = 2.06 *) 10 (-3)). Hơn nữa, hiệu quả điều trị thực sự không liên quan trực tiếp đến chủng tộc hay sắc tộc - người Mỹ gốc Phi thường là người mang kiểu gen T / T hơn người châu Âu và châu Á. Kiểu gen CC chủ yếu được tìm thấy ở những người bị nhiễm trùng tự phát. Thật thú vị, đối với kiểu gen CC, tải lượng virus (lượng virus trong máu) trước khi điều trị cao hơn so với kiểu gen T / T [134].
Kiểu gen T / T có liên quan đến việc loại bỏ nhiễm trùng tự phát, bất kể điều trị [54].
G alen cho rs8099917 là một alen có nguy cơ liên quan đến đáp ứng thấp với liệu pháp kết hợp interferon và ribavirin pegylated [90, 111].
Các nghiên cứu về vai trò của các đa dạng di truyền ở các khu vực của bộ gen người đã chỉ ra rằng giá trị tiên đoán dương tính của IL28B cao hơn các yếu tố dự báo khác về thành công điều trị (chỉ số khối cơ thể, tuổi, giai đoạn xơ hóa và tải lượng virus).
Tuy nhiên, các nghiên cứu về số lượng lớn bệnh nhân CHC có biểu hiện lâm sàng khác nhau (giai đoạn xơ hóa từ 0 đến 4, mức độ ban đầu thấp và cao), cho thấy giá trị tiên đoán của kiểu gen IL28 cho thành tích SVR có thể được sửa đổi đáng kể những đặc điểm lâm sàng này và giảm xuống còn 37,3% từ 74,4% cho bệnh nhân có kiểu gen CC [2, 101].
Do đó, vẫn cần phải xem xét các đặc tính cơ bản của giai đoạn bệnh của một bệnh nhân, nhưng phức tạp với các dấu hiệu di truyền của nó.
Hiện tại có 11 kiểu gen được xác định, lần lượt được trình bày trong một số kiểu con. Các kiểu gen và kiểu con khác nhau được phân bố không đều ở các vùng khác nhau trên thế giới. Ở Nga, kiểu gen chiếm ưu thế là 1b, tiếp theo là 3a, 1a và 2a với tần suất giảm. Nó cho thấy rằng đa hình IL28B có giá trị lớn nhất khi nhiễm HCV kiểu gen 1 kiểu phụ [7, 110].
Dựa trên điều này, một thuật toán sàng lọc được sử dụng để chuẩn bị điều trị được khuyến cáo (Hình 40).
Hình 40. Thuật toán sàng lọc được đề xuất trước khi bắt đầu điều trị viêm gan C
Dân số châu Á có sự mất cân bằng mạnh mẽ trong độ bám dính giữa rs12979860 và rs8099917, nhưng dân số châu Âu có độ bám dính yếu hơn, trong một số trường hợp, yêu cầu phân tích haplotypes (xem Bảng 66).
Bảng 66. Xác định haplotype trên sự kết hợp của kiểu gen rs12979860 và rs8099917
Генотип
|
rs 8099917
|
T/T
|
T/G
|
G/G
|
rs 12979860
|
C/С
|
CT/CT
|
|
|
С/T
|
CT/TT
|
CT
|
/TG
|
|
T/T
|
TT/TT
|
TT
|
/TG
|
TG/TG
|
Kiểu gen rs12979860 CC có tác dụng tích cực mạnh hơn đối với việc điều trị hơn kiểu gen rs8099917 TT. Mặt khác, sự kết hợp TT rs12979860 và GG rs8099917 phổ biến hơn ở những bệnh nhân không đáp ứng với điều trị. Kiểu gen G80 rs8099917 bất lợi hóa ra là quan trọng nhất trong việc dự đoán sự thiếu đáp ứng với điều trị [93].
Việc xác định kiểu gen của bệnh nhân trên IL28B có thể thay đổi phương pháp điều trị (thay đổi trong thời gian điều trị chuẩn PEG-IFN / RBV hoặc gấp ba CHC). Tối ưu hóa điều trị sẽ giúp tránh tác dụng phụ và chi phí bổ sung cho điều trị gấp ba bằng thuốc ức chế protease (telaprevir và boceprevir).
Chỉ định phân tích di truyền:
-
Dự đoán kết quả bệnh;
-
Lựa chọn giữa liệu pháp phối hợp interferon và ribavirin kết hợp tiêu chuẩn và pegylated để điều trị CHC;
-
Lựa chọn các chiến thuật “chờ đợi khả năng tiếp cận điều trị ba lần chất ức chế HCV protease” hoặc điều trị theo chương trình chuẩn của interferon và ribavirin phác đồ phối hợp kép cho bệnh nhân với các yếu tố bổ sung (trừ xơ gan) làm giảm khả năng điều trị bằng thuốc của điều trị kháng virus chuẩn hiện có
DNA-Technology đã phát triển bộ kits (xem Bảng 67 và 68) để xác định các đa dạng interleukin 28B sử dụng kỹ thuật real-time PCR .
Các thiết bị DT được sản xuất bởi DNA-Technology: DTlite, DT- prime.